Afin de récupérer les zones dégradées à la suite de l’abandon des terres précédemment labourées en raison de la difficulté d’accès par des moyens mécaniques, et affectées par l’érosion, la zone a été reboisée avec des pins d’Alep. Nous pouvons citer la pinède de La Pinarosa à Ariño, qui profite des ravins et des zones ombragées de la chaîne de montagnes Arcos et de ses contreforts, ou la pinède de Los Molares, qui occupe les vallées et les versants de la rivière Seco et des ravins affluents entre Oliete et Alcaine.
Le climat méditerranéen continentalisé, résultat de l’immersion par la vallée de la rivière Martín dans un environnement montagneux, pauvre en ressources hydriques et avec de forts contrastes de température entre le jour et la nuit, permet l’existence de genévriers, certaines communautés importantes de genévriers noirs étant situées dans différentes parties du Parc et s’adaptant aux zones rocheuses escarpées, accompagnées dans de nombreux cas de genévriers. Cependant, le genévrier est moins fréquent, mais plus spectaculaire, et il existe quelques spécimens épars et monumentaux dans le Parc, dont ceux de San Pedro à Oliete et de La Dehesa à Alcaine, entre autres.
D’autre part, la végétation riveraine est abondante, formant une bordure étroite et discontinue sur les rives de la rivière Marín, dominée par des peupliers, des saules, des frênes, des ormes, des joncs et des ronces, avec des tamaris en queue du réservoir de Cueva Foradada, qui forment une petite forêt d’une énorme importance écologique, et dans de nombreux ravins et étangs des affluents où domine la végétation hygrophile.
Un autre aspect à souligner sont les parcelles de végétation « ordonnées » dont l’origine réside dans le besoin de l’homme de produire de la nourriture par le biais de l’agriculture, avec des plantations en bord de rivière (cultures horticoles et arbres fruitiers) et des plantations pluviales (cultures céréalières, vignes, oliviers et amandiers).
